《神農本草經》記載中藥365種（其中植物藥252種，動物藥67種，礦物藥46種），分上、中、下三品。 上品中藥： 玉石（上品）：丹沙 雲母 玉泉 石鐘乳 涅石 消石 樸消 滑石 石膽 空青 曾青 禹余糧 太乙余糧 白石英 紫石英 青石、赤石、黃石、白石、黑石脂等 白青 扁青 草（上品）：菖蒲 鞠華 人參 天門冬 甘草 幹地黃 術 菟絲子 牛膝 充蔚子 女萎 防葵 柴胡 麥門冬 車前子 木香 署豫 薏苡仁 澤瀉 遠誌 龍膽 細辛 石斛 巴戟天 白英 白蒿 赤箭 奄閭子 析蓂子 蓍實 赤芝 卷柏 藍實 芎 蘼蕪 黃連 絡石 蒺藜子 黃耆 肉松蓉 防風 蒲黃 香蒲 續斷葉 漏蘆 營實 天名精 決明子 丹參 茜根 飛廉 五味子 旋華 蘭草 蛇床子 地膚子 景天 茵陳 杜若 沙參 白兔藿 徐長卿 石龍芻 薇銜 雲實 王不留行 升麻 青蘘 姑活 別羈 淮木 木（上品）：牡桂 菌桂 松脂 槐實 枸杞 柏實 伏苓 榆皮 酸棗 蘗木 幹漆 五加皮 蔓荊實 辛夷 桑上寄生 杜仲 女貞實 木蘭 蕤核 橘柚 人（上品）：發髲 獸（上品）：龍骨 麝香 牛黃 熊脂 白膠 阿膠 禽（上品）：丹雄雞 雁肪 蟲魚（上品）：石蜜 蜂子 蜜蠟 牡蠣 龜甲 桑蜱蛸 海蛤 文蛤 蠡魚 鯉魚 果（上品）：藕實莖 大棗 葡萄 蓬蔂 雞頭實 米谷（上品）：胡麻 麻賁 菜（上品）：冬葵子 莧實 瓜蒂 瓜子 苦菜 中品中藥： 玉石（中品）：雄黃 石流黃 雌黃 水銀 石膏 慈石 凝水石 陽起石 孔公蘗 殷孽 鐵精 理石 長石 膚青 草（中品）：幹姜 枲耳實 葛根 括樓根 苦參 當歸 麻黃 通草 芍藥 蠡實 瞿麥 元參 秦艽 百合 知母 貝母 白芷 淫羊藿 黃芩 狗脊 石龍芮 茅根 紫菀 紫草 敗醬 白鮮 酸醬 紫參 槁本 石韋 萆薢 白薇 水萍 王瓜 地榆 海藻 澤蘭 防己 款冬花 牡丹 馬先蒿 積雪草 女菀 王孫 蜀羊泉 爵床 假蘇 翹根 木（中品）：桑根白皮 竹葉 吳茱萸 卮子 蕪荑 枳實 厚樸 秦皮 秦菽 山茱萸 紫葳 豬苓 白棘 龍眼 松羅 衛矛 合歡 獸（中品）：白馬莖 鹿茸 牛角(角思) 羖羊角 牡狗陰莖 羚羊角 犀角 禽（中品）：燕屎 天鼠屎 蟲魚（中品）：猬皮 露蜂房 鱉甲 蟹 柞蟬 蠐螬 烏賊魚骨 白僵蠶 蛇魚甲 樗雞 蛞蝓 石龍子 木虻 蜚虻 蜚廉 蟅蟲 伏翼 果（中品）：梅實 米谷（中品）：大豆黃卷 神農本草經》之粟米 黍米 菜（中品）：蓼實 蔥實 水蘇 下品中藥： 玉石（下品）：石灰 礜石 鉛丹 粉錫 代赭 戎鹽 白堊 冬灰 青瑯玕 草（下品）：附子 烏頭 天雄 半夏 虎掌 鳶尾 大黃 亭歷 桔梗 莨蕩子 草蒿 旋復花 藜蘆 芫華 鉤吻 射幹 蛇合 恒山 蜀漆 甘遂 白斂 青葙子 雚菌 白芨 大戟 澤漆 茵芋 貫眾 蕘花 牙子 羊躑躅 商陸 羊蹄 扁蓄 狼毒 白頭翁 鬼臼 羊桃 女青 連翹 蘭茹 烏韭 鹿藿 蚤休 石長生 陸英 藎草 牛扁 夏枯草 木（下品）：巴豆 蜀菽 皂莢 柳華 楝實 郁李仁 莽草 雷丸 桐葉 梓白皮 石南 黃環 溲疏 鼠李 藥實根 欒華 蔓椒 獸（下品）：豚卵 麋脂 鳥畾鼠 六畜毛蹄甲 蟲魚（下品）：蝦蟆 馬刀 蛇蛻 蚯蚓 蠮螉 吳蚣 水蛭 班苗 貝子 石蠶 雀甕 蜣螂 螻蛄 馬陸 地膽 鼠婦 熒火 衣魚 木（下品）：桃核仁 杏核仁 米谷（下品）：腐婢 菜（下品）：苦瓠 水靳
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