疣的治療取決於位置、類型、嚴重程度和它在皮膚上存在的時間。
大部分尋常疣可以在兩年內自行消失，無需治療。疣數量少時首選冷凍保存或激光治療；數量較多時，可口服免疫調節劑。無論何種治療，約1/3疣可能復發。
1.局部療法
(1)液氨冷凍療法:用無菌棉簽蘸液氮直接壓迫皮損，每次20 ~ 30秒，反復2 ~ 3次，直至結痂脫落。
(2)微波、電離和激光療法。
(3)外用藥物:3%酞酰胺乳膏、3%酞酰胺二甲亞碸、0.05% ~ 0.1%維a酸軟膏或阿達帕林乳膏等。，1 ~每天2次。另外，平陽黴素10mg用1%普魯卡因20ml稀釋後，註入疣體根部，每疣註射0.2~0.5ml，每周1次，對尋常疣有較好療效。
2.系統療法
療效往往不確定，嚴重者可作為輔助治療。對於數量較多或長期不治之癥者，可選擇肌內註射或皮下註射如多精細胞註射、幹擾素等。中藥還可以疏風平肝，清熱解毒，散結。
(1)左旋咪唑，每日150 mg，口服3次，停藥3個月11天。
(2)柴胡註射液，每次2 ml，每日1次，肌肉註射，10 ~ 20次為壹療程。
(3)也可用三氯乙酸或斑蝥素，可破壞疣組織；但是有時候老疣的邊緣會長出新疣。