(壹)追根溯源看理論基礎:
中醫——在古代哲學的影響下，通過長期的臨床實踐發展起來，並在長期的實踐中得到驗證。基本特征是整體觀念和辯證處理。哲學基礎的核心理論是陰陽學說和五行學說。使用的思維方法有比較法、演繹法、類比法、表裏如壹法、試探法、反證法等。
西醫——理論來源於實驗科學的發展，嚴格依賴實驗數據和結果，仔細觀察實驗對象，按照嚴密的邏輯思維得出結論。
(二)和諧對抗看治療過程:
中醫——中醫天然利用自然界的草藥和食物，同時利用刮痧、按摩、針灸等其他輔助療法。中醫不使用合成化學手段。中醫強調陰陽平衡，其治療目的是幫助身體恢復平衡，達到內外和諧的狀態。
西醫——過去理論上的病菌和西醫壹對壹的關系不再成立。很多傳統疾病過去用了壹種很有效的西藥，今天用不了了。西醫的藥性在不斷升級，自然界的細菌也在不斷進化，這就成了人類制造藥物與自然日益對抗的惡性循環局面。西醫強調與疾病對抗，治療目的是消除疾病。
(3)治標，看治療效果:
中醫--具有整體觀念的治療理論。認為壹個器官的疾病不是單獨由它本身引起的，而是與其他器官密切相關的，人體也與自然環境和社會環境密切相關，是壹個整體。所以要整體考慮，綜合對待。中醫的治療通常能達到標本兼治的效果。
西醫-簡化論者和微觀治療理論。它可以詳細檢查壹個器官的結構特征，然後采取相應的藥物，給予精準的靶向治療。可以詳細判斷引起感染的微生物的性質，然後應用相應的抗生素進行治療。可以對壞死和患病的器官進行精確的外科治療。西醫的治療是有的放矢的，但往往無法做到標本兼治，反復發作。
衡量的標準是什麽？什麽是真正的科學？在西醫壹統天下的局面下，主流聲音主張必須經過實驗驗證，經過邏輯思維的嚴格推導，才能稱之為科學。但是中醫幾千年的實踐驗證療效是不能否定的，在未知領域壹味否定是不科學的。我們需要的是重建現代中醫體系，使之符合現代科學，而不是以“西醫的標準”來評判中醫是否科學！