小檗堿是壹種抗菌消炎的藥物，易溶於水(每20ml水1g)，不溶於有機溶劑，而鹽酸小檗堿不溶於水，溶於有機溶劑，所以可以利用這壹特性提取。
第壹，原材料
原料為刺黃連、黃柏的葉、皮和根、硫酸、生石灰、鹽和95%酒精。
二、提取方法
(壹)硫酸浸出法
1.浸出:將黃連、黃柏粉碎成粉末，用0.5%硫酸水溶液浸泡24小時，並不斷攪拌。將浸泡液過濾，濾液為硫酸小檗堿，加入石灰乳，調節濾液pH值至8-9，使硫酸根和石灰中和生成硫酸鈣沈澱，藥材中的其他雜質也沈澱出來:吸取上清液鹽析。
2.鹽析:在清液中加入5-6%的鹽，使黃連素在濃鹽水溶液中沈澱，沈澱完全後過濾，濾餅即為黃連素粗品。將粗品溶於5倍的沸水中，趁熱過濾除去雜質。向濾液中加入鹽酸，調節pH值至2，冷卻，析出較純的小檗堿晶體，過濾，80℃恒溫幹燥，即得鹽酸小檗堿成品。
(2)石灰法
將黃柏或小檗粉碎成粉末，加入1/10氧化鈣細粉，用50倍的冷水浸泡，頻繁攪拌，24小時後過濾，得到棕紅色濾液(濾餅可再次浸出)，加入濾液5%的鹽，攪拌溶解，黃連素在鹽溶液中沈澱。沈澱完全後，過濾，濾餅即為黃連素粗品。將粗品溶於20倍的沸水中，然後加入鹽酸調節pH值至2，冷卻後沈澱出較純的黃連素晶體，濾出，80℃恒溫幹燥，即得鹽酸黃連素成品。
(3)粘酒法
1.滲濾:將黃柏粉碎成粉末，用溶劑(酒精)浸泡潤濕，溶脹後裝入帶篩板的滲濾筒中。然後從高位槽向桶內加入酒精，粉末中的有效成分浸泡在酒精中，流入接收槽，直至滲漉液幾乎為酒精的原色，即可停止滲漉，取出桶內的粉末殘渣。
2.蒸餾鹽析:將滲漉液蒸餾，蒸餾液為酒精，回收再利用。當釜液為濃糖漿時，加入與粉末等量的開水，攪拌至溶解。此時，沈澱出樹脂狀沈澱物，過濾除去，濾液為小檗堿的水溶液。向濾液中加入鹽酸，調節pH值為2，靜置6-8小時，析出鹽酸小檗堿，過濾，用少量蒸餾水洗脫多余的鹽酸，80℃恒溫幹燥，即得成品。
如果上述質量不符合要求，可以通過重結晶進壹步提純。