由於亞臨界流體在常溫常壓下處於氣態，非常容易汽化，因此可以在常溫或更低的溫度下萃取分離熱敏性物質。經過實踐，亞臨界流體萃取技術已經應用於許多天然產物中脂溶性成分的提取。如欒樹種子、無患子果實、青刺果實、沙棘果實、黃連木果實、虎果、玫瑰、薰衣草、銀杏葉、黃花蒿等。
在食品工業中的應用
亞臨界流體萃取技術在食品工業中的應用主要集中在食用植物粉末的脫脂和副產品油脂的應用。由於壹些植物果實富含油脂，高油食品容易酸敗，保質期短，植物粉的脫脂成為制約植物粉生產的關鍵環節。采用亞臨界流體萃取技術對大豆、花生、核桃、杏仁、小麥胚芽、咖啡豆、南瓜籽等幾十種物料進行脫脂生產，並通過萃取得到相應的植物油。從提取效果來看，低溫下獲得的植物粉末的活性成分得到了最大程度的保護。以植物蛋白為例，水溶性蛋白指數NSI在86%以上，小麥胚芽油的ve成分在95%以上。與其他方法相比，具有明顯的優勢:處理物料量壹般為30-100噸/日，提取時間短，成本低。隨著天然產物的開發，亞臨界流體萃取技術在食品工業中有著更廣闊的應用前景。
此外，亞臨界流體對全脂奶粉提取奶油效果良好，提取率在20%以上，提取的奶油口感純正，是從奶粉(包括過期奶粉)中提取奶油的最佳生產工藝。
在中藥(包括復方中藥)行業的應用
亞臨界流體萃取在中藥工業中的應用已涉及中藥有效成分和復方中藥的提取，並已實現工業化生產。如五味子、紅花、川芎、靈芝孢子、水飛薊、栝樓籽、當歸、刺五加的亞臨界萃取優於石油醚萃取，具有比超臨界萃取日處理量大、收率高、萃取周期短、無溶劑殘留等優點，特別適用於中藥脂溶性活性成分的提取。
此外，由於許多中藥中的脂溶性成分在中成藥生產中存在不同程度的副作用，因此亞臨界流體萃取在中藥炮制前的脫脂處理中有很大的發展空間。
在動物脂肪提取中的應用
在動物油提取方面，我們首先從林蛙卵中提取了林蛙卵油，從黃粉蟲中提取了黃粉蟲油，從蠶蛹中提取了蠶蛹油，從蠍子中提取了蠍子油，從羊蹄中提取了羊蹄油。
在天然色素工業中的應用
近年來，亞臨界流體萃取技術在色素提取方面取得了很大進展。在河北、山東、雲南、新疆、甘肅、吉林等地有十余條亞臨界流體萃取生產線，主要從事辣椒紅色素、萬壽菊黃色素、番茄紅色素、姜黃素、蠶米綠色素的生產。
在天然香料工業中的應用
在天然香料工業中，已經提取了玫瑰提取物、香菜提取物、薄荷提取物、桂花提取物、茉莉提取物和可可脂等產品。
在特殊油脂中的應用
在特種油脂的生產中，已經涉及到小麥胚芽油、葡萄籽油、杏仁油、南瓜籽油、亞麻籽油、石榴籽油、橙子籽油、櫻桃籽油、沙棘油、花椒油、葵花籽油、亞麻籽油、綠刺果油、松子油、大蒜油、洋蔥油、姜油等幾十種特種油脂。