基本醫療保險藥品目錄由甲類藥品目錄和乙類藥品目錄兩部分組成。
甲類藥品是指由國家統壹制定的、臨床治療必需,使用廣泛,療效好,同類藥物中價格低的藥物，使用這類藥物所發生的費用納入基本醫療保險基金給付範圍，按基本醫療保險辦法的規定支付費用。甲類藥品100％按照報銷比例報銷。
醫保乙類是指乙類藥品，基本醫療保險基金有能力支付部分費用的藥物。使用這類藥品產生的費用先由參保人員自付壹定比例的費用後，再納入基本醫療保險基金給付範圍，並按基本醫療保險的規定支付費用。甲類藥品100％按照報銷比例報銷。乙類要自付壹部分，報銷壹部分，具體的報銷比例根據各地政策和具體藥品而有所不同。
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