1.藥品基本目錄，可能是指基本藥物目錄，是醫療機構用藥最基礎的目錄，2009年頒布的目錄包含205個西藥品規，102個中藥品規。
2.藥品醫保目錄，是人力資源和社會保障部頒布的國家基本醫療保險、工傷保險和生育保險藥品目錄。是各種醫療保險報銷藥品的依據。基本藥物目錄的藥品全部包含在醫保目錄裏。
3.藥品中標目錄，是各省開展醫療機構藥品集中采購後，中標的產品形成的目錄。這些藥品既包括基本藥物也包括醫保目錄和非醫保目錄。
4.新農合藥品目錄，是各省市實施新型農村合作醫療，使用的藥品目錄，不同地區可能制定不同的目錄，報銷比例也可以不同。
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