然而普通的招標采購則不是如此，兩者之間的區別還是挺明顯的。
1、藥品招投標的區域由分散走向集中，針對藥廠、藥品經營公司而言，節省了招投標的大量人力和物力，是低成本的選擇；針對醫療機構而言，醫療機構加價的收益仍在持續，醫生的臨床費用（即回扣）仍會保證，它們不持反對意見；針對患者而言，降價的幅度預計大過以往招投標，因此對此次招投標抱有較大的期望。
2、藥品招標的主動權由藥品經營公司轉移到藥廠。
3、藥廠對壹、二級配送商的選擇弱化了終端網絡的強勢地位。
4、藥品中標的概率大大提高了，競爭更加激烈。藥品招標中標的概率由過去的三家增加到多家，意味著銷售將會比以往更加激烈和殘酷，為了保證產品中標，價格勢必進壹步走低。