1，不同類別。保健酒屬於“露酒”，藥酒屬於“藥”的範疇；
2，功能不同。保健酒主要用於調節生理機能，以保健、養生、強身為目的。藥酒主要用於治療疾病，有其特定的醫療作用；
3.不同的生產管理部門。保健酒是食品企業生產，食品部門主管。藥酒由藥廠生產，由藥監部門負責；
4.適用的人和對象不壹樣。保健酒對年齡和性別沒有特別嚴格的限制，主要是健康或亞健康人群飲用。藥酒對適用人群針對性強，使用對象為疾病患者，需在醫生處方下或專業人員指導下服用；
5.銷售地點不壹樣。保健酒主要在酒店、商場、超市等壹般銷售場所銷售。藥酒主要在藥店或醫療場所出售。