主要包括設備費用、業務費用和人工費用。
國家R&D重點計劃(以下簡稱R&D重點計劃)由若幹目標和邊界明確的重點項目組成，重點項目從基礎前沿、重大關鍵技術到應用示範壹體化組織實施。重點專項包括項目，項目可以根據自身特點和需求包含課題。重點專項實行預算管理，重點專項實行預算管理。
R&D計劃重點資金來源多元化，資金來源分為中央財政資金和其他資金來源，包括地方財政資金、單位自籌資金和其他渠道獲得的資金。中央財政資金支持方式包括前補助和後補助，具體支持方式應在編制重點專項實施方案和年度項目申報指南時予以明確。
本辦法主要規範中央財政安排的以前補助方式支持的R&D計劃重點資金，後補助方式支持的資金按照中央財政科技計劃後補助的有關規定執行。地方財政資金、單位自籌資金和其他渠道獲得的資金，應當按照國家有關財務會計制度和相關資金提供者的具體使用管理要求統籌安排使用。
在前期補助支持的R&D重點項目中，采用“揭牌”、“賽馬”等新型組織機制的項目，可根據項目特點，采取合同管理等資金管理方式。