小兒腺樣體肥大的內科治療，主要是保持鼻腔通暢，通氣，局部可以用減鼻充血的0.5%呋麻滴鼻液和鼻用激素內舒拿。口服抗過敏，左西替利嗪口服液以及抗炎藥。合並感染需要加用足量的抗生素類如頭孢類，壹般可以用頭孢克肟顆粒或者頭孢丙烯，頭孢地尼之類的。如果頭孢類過敏，可以選擇大環內酯類的紅黴素或者阿奇黴素。配合鼻腔3%生理海水沖洗，早晚各壹次。以及布地奈德霧化治療。
如果出現了過敏的情況，還需要搭配使用治療過敏的藥物，如開瑞坦。此外，小兒腺樣體肥大單純使用西藥治療的效果不明顯，還可以結合中藥來治療，中藥主要是以清熱、健脾等藥物為主，如鵝不食草等。