對於導致內分泌功能亢進的疾病，可通過藥物抑制激素的合成，如用咪唑類或磺酰脲類藥物治療甲亢；激素受體也可被藥物阻斷，如治療庫欣綜合征的米非司酮；藥物也可用於維持體內激素平衡，如治療醛固酮增多癥的螺內酯。
對於導致內分泌功能低下的疾病，可以通過藥物補充體內激素含量，維持體內激素平衡，如氫化可的松？治療慢性腎上腺皮質功能減退可以補充暫時的激素缺乏。