因此，必須在37攝氏度以下的水中或牛奶中服用。37攝氏度以上的活菌會被燙死。使用抗生素時，需要兩小時後服用有益菌和活菌的保健品，也是這個道理，因為抗生素會殺死有益菌和活菌。
其實不光是保健品，還有藥品。含有益菌和活菌的藥物不宜與37度以上的水同服。服用後半小時內不能喝過熱的水或食物，也不能同時服用抗生素。服用抗生素前必須間隔兩小時服用。
附衛生部(2006 54 38+0)84號文件中9種可供益生菌食品的菌種名單:
雙歧桿菌、嬰兒雙歧桿菌、長雙歧桿菌、短雙歧桿菌、青春雙歧桿菌、嗜酸乳桿菌、幹酪乳桿菌亞種。幹酪，嗜熱鏈球菌，保加利亞乳桿菌。