苗藥主要分布在苗嶺山區、烏蒙山區、武陵山區等苗族聚居區。由於各地區的緯度、地理環境、用藥習慣不同，各類藥物的分布也有差異，有的品種如：見血蠅、魚腥草、銀花、桔梗等幾乎到處都有分布；而有的品種如：艾納香、馬檳榔、金鐵鎖、松蘿、紫金蓮等則僅限於壹定地區和壹定海拔高度才有分布。近年來，我國在苗族聚居的廣大地區建立了壹批藥材種植生產基地，大力發展天麻、茯苓、獨活等常用藥材的人工種植。