1、註冊是對執業藥師資格的確認和資格許可，是執業藥師開展執業活動的前提條件。只有通過註冊程序，獲得《執業藥師註冊證》，執業藥師才具備了從事藥學咨詢、藥品處方審核、藥品銷售和藥學服務等活動的資格。而備案只是壹種行政管理的手段。
2、《中華人民***和國中醫藥法》和《醫療機構管理條例》等法律法規規定，中醫診所必須依法取得《醫療機構執業許可證》並按照許可證核定的診療科目開展診療活動。中醫診所需要有註冊3年的執業醫師，或中醫醫師才可。備案用於對執業藥師執業活動進行記錄和管理，並不涉及執業藥師的執業資格和執業範圍。