1.硫酸軟骨素作為保健食品或保健藥品，長期用於冠心病、心絞痛、心肌梗塞、冠狀動脈粥樣硬化、心肌缺血等疾病的預防和治療，無明顯毒副作用，可明顯降低冠心病患者的發病率和死亡率。長期臨床應用發現，可有效清除或減少沈積在動脈和靜脈壁上的脂肪等脂質，顯著降低血漿膽固醇，從而防止動脈粥樣硬化的形成。
2.硫酸軟骨素可用於治療神經痛、神經性偏頭痛、關節痛、關節炎和肩胛關節痛以及腹部手術後疼痛。
3.用於預防和治療鏈脲佐菌素引起的聽力障礙以及各種噪音引起的聽力困難和耳鳴。