現行食品藥品監督管理機構省級以下垂直管理改為由省、市、縣政府分級管理，業務接受上級主管部門和同級衛生部門的組織指導和監督。對省、市、縣三級食品藥品監督管理機構與同級衛生部門職能進行整合，以切實加強食品藥品安全監管，落實各級政府食品藥品安全綜合監督責任。調整後，省級食品藥品監督管理機構作為省政府的工作機構，由省級衛生部門管理。市、縣食品藥品監督管理機構作為同級政府的工作機構，在調整有關職能的基礎上，保持隊伍和人員相對穩定，保證其相對獨立地依法履行職責，保證其對消費環節食品安全和藥品研究、生產、流通、使用全過程的有效監管。其行政編制分別納入市、縣行政編制總額，審批權限由省壹級行使調整為市、縣兩級機構編制部門分別行使。市級食品藥品監督管理機構所屬技術機構的人員編制、領導職數，由市級機構編制部門管理。