1、成分不同：醫用酒精是藥用乙醇，不含甲醇，而乙醇消毒液是分析純或化學純乙醇，可能含有甲醇。
2、用途不同：乙醇消毒劑主要用於皮膚消毒，而醫用酒精根據濃度不同用途也不同，其中25%-50%用於物理退熱，40%-50%用於預防褥瘡，70%-75%用於消毒，95%用於擦紫外線燈。
乙醇消毒劑的使用方法如下：
手部消毒時，將消毒劑均勻噴灑或擦拭手部1-2次，每次1分鐘，手術手消毒擦拭2次，每次3分鐘。
皮膚消毒時，將消毒劑均勻噴灑或擦拭皮膚表面兩次，每次 3 分鐘。
整個物體表面消毒時，將消毒劑均勻噴灑在物體表面，保持濕潤，然後擦拭物體表面 2 分鐘。
給溫度計消毒時，將溫度計完全浸泡在消毒液中 30 分鐘。