由於在藥品生產過程中始終有人的操作活動，所以是人是藥品生產過程中最大的汙染源。人自然活動時，人體散發出的熱量課形成壹股熱流，這股熱流便於微小粒子（大於0.3微米）的擴散，每分鐘大約能產生千百萬粒，大部分粒子是皮屑，其余大小為10~300微米。人體也會給微生物的生長繁殖創造壹個良好的環境，人體的各部位都生長著各類微生物，因此在制藥生產的各個階段中，都可能發生由人造成的藥品汙染，有的通過未消毒的手直接接觸藥品使其汙染，有的則經其他的的途徑能夠得接觸而引起藥品汙染。
如皮膚表面常見微生物有：葡萄球菌，枯草桿菌，大腸桿菌，類白喉桿菌，非致病性抗酸桿菌，真菌；鼻咽喉：大腸桿菌，綠膿桿菌，變形桿菌，腺病毒，真菌，葡萄球菌，類白喉桿菌等
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