雙分子熒光實驗是最先報道的壹種直觀、快速地判斷目標蛋白在活細胞中的定位和相互作用的新技術，該技術巧妙地將熒光蛋白分子的兩個互補片段分別與目標蛋白融合表達，如果熒光蛋白活性恢復則表明兩目標蛋白發生了相互作用，其後發展出的多色熒光互補技術，不僅能同時檢測到多種蛋白質復合體的形成，還能夠對不同蛋白質間產生相互作用的強弱進行比較。