醫藥回扣問題的根源，在於我國現行的極度畸形的醫療衛生管理體系：①醫療領域的中國特色的市場化，對醫療市場的行政壟斷和價格管制；②把很多政府應負的責任完全拋開；③以藥養醫；④讓“回扣”作為“灰色收入”成為醫生收入的必要補充[3]。