飲料中有啤酒、白酒、黃酒、葡萄酒、果酒等。
食物中，有酸菜、腐乳、酸奶、醬油、醋、味精等。
化學工業中有氨基酸、有機酸、澱粉酶、蛋白酶、木聚糖酶、脂肪酶、乙醇、乙醛、乙酸、丙醇、丙酮、丁醇、甲烷(即沼氣)、核苷酸等。
微生物在醫學上的應用屬於現代生物技術。最早是青黴素，此後各種抗生素層出不窮，其中大部分是放線菌產生的。還有維生素c，維生素e等等。現在，單克隆抗體生產的幹擾素產品也已經應用於臨床。用於基因重組技術，將其他生物的基因導入微生物，產生了很多產量低、提取困難的藥物，如紫杉醇。
簡而言之，微生物的工業應用技術