壹、批準文號不同
OTC是國藥準字，健字號是保健品。
二、產品上市條件不同
健字號藥物含量較低，所以保健品的生產只須衛生監督部的審查批準，而不需要經過醫院臨床實驗等便可投入市場。
藥字號產品是實行國家常規管理可以保證其安全有效的醫療用品，風險程度低。藥字號產品經過臨床檢驗和國家食品藥品監督管理局備案，是有臨床功效的可以直接寫在說明書上的。
三、功效不同
otc阿膠經過大量的臨床驗證，並通過國家藥品食品監督管理局審查批準，有嚴格的適應證，治療疾病有壹定療效；
而作為保健食品，則沒有治療作用。藥品允許出現壹定的毒副作用，但保健食品必須是安全的。在說明書上，藥品標註不良反應和禁忌癥，保健食品只需說明不適宜人群。