銷售免稅藥品不要計算銷項稅，但是要把對應的進項稅額轉出。
但是對應下面的情形要計算繳納銷項稅額。
對營利性醫療機構的藥房分離為獨立的藥品零售企業，應按法規計算繳納各項稅費。
非營利性醫療機構的藥房分離為獨立的藥品零售企業，應按法規計算繳納各項稅費。