(1)武陵山種植區，包括恩施、巴東、利川、鹹豐、鶴峰、建始等7個縣市。重點發展13個道地藥材品種，即：板黨、黃連、湖北貝母、獨活、五鶴續斷、自術、貫葉連翹、纈草、紫油厚樸、玄參、白三七、黃柏、杜仲。
(2)秦巴山種植區，包括鄖西、鄖縣、房縣、竹山、竹溪、丹江口、谷城、保康、南漳等9個縣市。重點發展黃姜、肚倍、麥冬、半夏、桔梗、黃連、杜仲、白柴胡等道地藥材。
(3)大別山優勢種植區，包括蘄春、英山、羅田、麻城等4個縣市。重點發展白術、菊花、茯苓、元胡、桔梗、射幹、天麻等道地藥材。
(4)幕阜山種植區，包括通城、崇陽、通山等3個縣市區。重點發展金銀花、菊花、白術、百合、厚樸、黃柏、辛夷花、金剛藤、杜仲等。
(5)神農架種植區，重點發展獨活、黨參、當歸、黃連等高山中藥材，以及冬花、絞股藍、柴胡、桔梗、丹參等中低山藥材和杜仲、黃柏等木本藥材。
(6)三峽種植區，包括五峰、長陽、遠安、宜都、夷陵、興山等6個縣市區。重點發展黨參、天麻、當歸、貝母、杜仲、厚樸、梔果、獨活、木瓜、辛夷花等品種，適當發展黃姜。