本品耐受性良好，常見不良反應是腹瀉、頭痛、惡心、腹痛、胃腸脹氣及便秘，偶見血清氨基轉移酶（ALT，AST）增高、皮疹、眩暈、嗜睡、失眠等，這些不良反應通常是輕微的，可自動消失，與劑量無關。長期治療未見嚴重的不良反應，但在有些病例中可發生胃粘膜細胞增生和萎縮性胃炎。
阿莫西林不良反應介紹：
1．惡心、嘔吐、腹瀉及假膜性腸炎等胃腸道反應。
2．皮疹、藥物熱和哮喘等過敏反應。
3．貧血、血小板減少、嗜酸性粒細胞增多等。
4．
血清氨基轉移酶可輕度增高。
5．由念珠菌或耐藥菌引起的二重感染。
6．偶見興奮、焦慮、失眠、頭暈以及行為異常等中樞神經系統癥狀。
兩者壹起吃會有頭痛頭暈的癥狀。
但是藥品的不良反應不是每個使用的患者都會發生的。
假若不是很嚴重，可以忍受的話，可以繼續服用，若是比較嚴重的話，就只有重新換其他的藥了。