治療支原體感染最常見的方法是使用抗生素。通常使用紅黴素治療該病，但患者在使用紅黴素時可能會出現壹些副作用，嚴重時甚至會出現胃腸道反應。如果患者有這種反應，可以選擇改用大環內酯類抗生素，如甲氧黴素、麥迪黴素、交沙黴素、亮黴素等。新壹代大環內酯類抗生素包括阿奇黴素和羅紅黴素等。由於這類藥物服用次數較少，副作用相對較小，患者壹般需要服用2~3周，否則容易復發。
2.中西醫結合
抗生素屬於西藥，西藥治療也要用中藥，會更有幫助。中醫治療不僅僅是針對支原體，還可以調節機體的免疫功能，增強患者的呼吸功能，從而促進疾病更快康復。
二、支原體感染的日常護理
1.註意個人衛生
大多數人會因為不註意個人衛生而患上支原體感染，所以需要特別註意私處的衛生，不僅要勤換內褲，還要每天用溫水清洗私處。在治療過程中，患者還應每天將個人衣物、毛巾用開水浸泡5~10分鐘，可有效殺菌消毒。他們也應該經常洗手，盡量不使用公共廁所。
註意飲食
衣原體感染患者應盡量不吃辛辣食物，不抽煙喝酒。應該多吃清淡易消化的食物，如韭菜、香蕉等，可以增強患者的免疫力。
關註性生活
患者患支原體感染後，最好不要發生性行為，以免交叉感染。另外，如果男女壹方患病，另壹方要及時去醫院檢查治療。而且雙方的生活用品都需要隔離。即使患者治愈後，也要註意性生活安全，采取安全措施，避免復發。