1、相同點：專利期限補償和藥品都是為了延長專利權的有效保護期限，保障專利權人的經濟利益。
2、不同點：專利期限補償針對藥品專利和發明專利在授權過程中不合理延遲的情況，旨在合理分配專利授權延遲的責任；而藥品審批期限補償則是為補償新藥上市審評審批占用的時間，對在中國獲得上市許可的新藥相關發明專利，應專利權人的請求給予專利權期限補償。