在某些細菌的協同作用下，阿米巴體內的裂解組織會對機體產生較強的致病作用，它不僅能攝取腸道內細菌分解的食物，還能利用細菌提供的理化條件進行增殖和活動，甚至直接攝取細菌。試驗表明，機體吞食其純膠囊和純細菌都不會發病，而吞食混有細菌的膠囊卻會出現急性阿米巴痢疾的癥狀。這是因為細菌能引起適宜的氧化還原電位和氫離子濃度，促進阿米巴的增殖和阿米巴毒素的分泌，從而削弱宿主全身或局部的抵抗力。細菌還能直接破壞機體的腸道黏膜，為蠕蟲入侵腸道組織提供有利條件。某些革蘭氏陰性菌與阿米巴混合培養，可明顯提高實驗動物的感染率和病變程度；表面附著的細菌滋養體，還可憑借甘露糖結合凝集素或阿米巴260庫半乳糖/乙酰氨基半乳糖凝集素，增強阿米巴對宿主細胞的裂解作用。
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