醫院和藥店有不同的操作系統。醫院是執行壹定福利政策的社會福利機構。為了讓患者安心看病治病,他們會在醫療設施和醫護人員上下很大功夫。醫院在配備藥品時,會經過很多環節,無形中增加了成本。而且由於政府對醫院的資金投入有限,醫院在價格上也不靈活。藥房是具有獨立法人的經濟實體,藥品采購成本和運營成本與醫院不同。還可以靈活調整價格和營銷策略,實現薄利多銷。醫院和藥店的藥物結構不同。醫院不僅僅是給患者開藥,為了更好的預防和治療疾病,還需要不斷的研發新藥,並且通過全方位的臨床實驗,新藥才能有效。病人在醫院開了藥,接受了專業醫生的指導。考慮到這方面的成本,國家會相應提高醫院的藥品價格。相比之下,藥店似乎更有比較優勢,多賣低價藥和常用藥以量取勝,讓消費者誤以為藥店的藥品價格比醫院便宜。