(壹)自查階段(5月-6月底)
各地各類學校要按照整改方案要求，從學校食品安全管理、餐飲服務許可、環境衛生、健康證、索證索票管理、加工制作管理制度、清洗消毒、食品添加劑使用等八個方面開展自查，深入查找存在的突出問題和薄弱環節，認真整改。
(二)整改階段(7月-10年底)
各地食品藥品監管部門和教育行政部門要檢查指導各類學校自查工作，督促整改突出問題，落實整改措施。應該重點檢查發生食物中毒的學校。
(3)檢驗階段(11 —12)
國家美國食品藥品監督管理局和教育部將組成聯合檢查組，對各地的整改情況進行抽查。