①檢驗機構:負責產品的技術檢驗，出具檢驗報告。具體為各省、直轄市疾病控制中心(或衛生防疫站)、中國疾病預防控制中心營養與食品安全所、中國預防醫學科學院、部分醫學院校。
(2)受理處:負責對企業申請材料進行初步審查，符合要求的，安排產品參加評審會；將評估意見告知企業；向國家美國食品藥品監督管理局報告待批準的產品；頒發證書等。具體為各省、直轄市食品藥品監督管理局保健食品審批受理機構，國家美國食品藥品監督管理局保健食品受理辦公室和全國中藥品種保護審評委員會。
③評審委員會:負責申報產品的技術評審。具體為各省、直轄市初審委員會和國家醫藥產品管理局復審委員會。
(4)衛生行政部門:對通過審評委員會技術審評的產品進行進壹步審評，符合相關法律法規要求的，予以申報或批準，國家美國食品藥品監督管理局擁有最終批準權。批準的產品被授予保健食品批準文號。