芬太尼適用於外科、婦科術後及術中各種疼痛和鎮痛。也用於預防或減少手術後譫妄；也可與麻醉藥聯合使用，作為麻醉的輔助藥物；與氟哌利多配伍制成地西泮鎮痛藥，用於大面積換藥和小手術鎮痛。
4月1日，2065438，公安部、國家衛生健康委員會、國家醫用制品監督管理局聯合發布公告，宣布自201日起，將芬太尼納入《非醫用麻醉藥品和精神藥品管制品種補充目錄》。