1、含義不同：藥品報銷比例是指醫療保險公司按照合同約定的比例對參保人員因病就醫發生的醫療費用進行報銷，而藥品零售價是指藥品的最終銷售價格，是消費者購買藥品時支付的價格。
2、影響因素不同：藥品報銷比例的影響因素有起付線、封頂線等，而藥品零售價的影響因素有供求關系、價值規律等。
3、計算方式不同：藥品報銷比例的計算方式為報銷金額=（總費用-起付線以下部分-封頂線以上部分）×報銷比例，而藥品零售價的計算方式為零售價=進貨價+運輸+人工等。