因為緊急避孕藥有兩種:雌激素和抗孕激素，所以很多人擔心長期使用可能會增加女性患癌的風險。但海外研究發現，與未使用口服避孕藥者相比，癌癥總體發病率下降12%，對卵巢疾病和子宮癌有預防作用。口服避孕藥的使用時間與子宮內膜癌的發病率成反比，對子宮癌的預防作用隨著使用時間的增加而增加。
雖然緊急避孕藥不會增加患癌風險，使其繼續降低某些惡性腫瘤的發病率，但仍不建議長期服用。其不良反應明顯，如惡心幹嘔、月經提前或推遲，壹般停藥後自行消退，但長期服用會增加宮外孕風險。根據meta分析科研meta，口服緊急避孕藥引起的宮外孕率是正常妊娠的2.45倍。
雖然口服避孕藥會增加乳腺癌的風險，但這種風險應該與其他疾病壹起“權衡和考慮”。眾所周知，口服避孕藥能有效幫助異常子宮出血和更年期出血，還能降低患卵巢癌、卵巢疾病、直腸癌等惡性腫瘤的風險。自然，這種得癌癥概率的降低並不是很大，但是人壹旦到了中年就會患上其他疾病，所以壹定要公平對待。