民營醫院增值稅稅率壹般納稅人是6%，小規模納稅人征收率3%，疫情期間1%。
不過從事醫療事業有優惠，比如：
根據《財政部國家稅務總局關於醫療衛生機構有關稅收政策的通知》(財稅[2000]42號)的規定：
(1)非營利性醫療機構按照國家規定的價格取得的醫療服務收入，免征各項稅收.醫療服務是指醫療服務機構對患者進行檢查、診斷、治療、康復和提供預防保健、接生、計劃生育方面的服務，以及與這些服務有關的提供藥品、醫用材料器具、救護車、病房住宿和夥食的業務；
(2)對營利性醫療機構取得的收入，直接用於改善醫療衛生條件的,自取得執業登記之日起，3年內給予下列優惠:對其取得的醫療服務收入免征營業稅。
(3)對疾病控制機構和婦幼保健機構等衛生機構按照國家規定的價格取得的衛生服務收入(含疫苗接種和調撥、銷售收入),免征各項稅收。