通過多年探索和努力，華源醫藥股份有限公司建立了創新的管理模式，為中國醫藥流通業企業管理機制和模式創新，樹立了新的典範。該管理模式概括起來，可以用“五統壹，壹分銷”來簡要描述。
五統壹：統壹購進，統壹倉儲，統壹財務，統壹票據，統壹價格
壹分銷：分公司銷售
公司始終把質量看作企業的生命。在“五統壹，壹分銷”管理模式下，藥品質量管理貫穿始終，從制度上杜絕了偽劣藥品進入流通環節的可能性；同時，該管理模式有利於調動全體員工的積極性，從而提高了整體運作效率和服務水平。