1、填寫藥店清算表：在藥店營業結束後，需要填寫藥店清算表，表格中需要包括藥品庫存、賬目清單等信息。
2、提交相關資料：除了藥店清算表，還需要提交藥品購銷發票、藥品配方、營業執照、稅務登記證等相關資料。
3、辦理藥店清算證明：填寫完藥店清算表並準備好相關資料後，需要向當地藥監部門辦理藥店清算證明。
4、審核並出具證明：當地藥品監管部門會對提交的資料進行審核，審核通過後會出具藥店清算證明，其中包括藥品庫存清單、藥品銷售清單、清算報告等。