1、國家基本藥物制度要求公立醫院必須把基本藥物作為首選藥物並達到壹定的使用比例，但對具體比例無明確要求，對基本藥物的使用量和使用比例的要求也缺乏明確依據。
2、我院屬於縣級醫院，承擔著打扮和疑難疾病的診治任務，其患者多為基層醫療機構轉診患者，而在基層醫院使用基本藥物不能解決的問題轉到我院後基本上都要調整用藥，現有的基本藥物仍不能滿足醫院的用藥需求。
3、醫院對基本藥物制度的宣傳力度不夠加上藥品廣告的誤導，不少患者仍存在廉價藥品療效差、貴藥與新藥療效好的錯誤認識，臨床醫生承擔較大壓力。
4、藥物研發能力提高、新藥上市數量增加，在新藥比老藥療效好、不良反應少的片面宣傳下，醫生偏向使用新藥。