乙類藥：可供臨床治療選擇使用、療效好，同類藥品中比甲類藥品價格高的藥品。參保人使用乙類藥品時，要先按比例（各地自行規定）扣除壹定的個人自付費用後，將余下費用再納入報銷範圍，按規定比例報銷。
乙類藥扣除自付後的費用，加上甲類藥全部費用，再加上診療等費用中符合醫保規定的費用，可用於累計參保人當年的起付線。對於超過起付線、未達封頂線的費用，依據患者本人參保類型、就醫醫院級別等按規定比例報銷。
計算公式如下：
醫保報銷的錢=（甲類藥品的全部費用+乙類藥品扣除自付部分+其他符合醫保規定的費用）-起付線*相應報銷比例
舉個例子：
假設城鎮職工老王某次就醫住院發生了醫保目錄範圍內的診療等費用 2000 元，甲類藥品費用 3000 元，乙類藥品費用 5000 元，乙類藥品的自付比例是 10%，當地起付線是 1300 元，本次就醫的費用未超過封頂線，城鎮職工醫保在該級別醫院的報銷比例為 80%。
那麽報銷方法是：
甲類藥全部費用 3000 元，加上將乙類藥品扣除自付外的其余費用 4500 元（乙類藥品自付部分為 5000*10%=500 元），再加上符合醫保規定的診療等費用 2000 元，合計 9500 元。扣除 1300 元的起付線，納入報銷範圍的費用是 8200 元。
則本次老王的醫療費用，醫保能夠報銷 8200*80%=6560 元，老王需要自己承擔 3440 元（起付線 1300 元 + 乙類藥自付的 500 元 + 醫保政策範圍內按比例由個人負擔的 1640 元）。