國藥股份和中國醫藥雖然作為獨立的上市公司運營，但在所有者結構上有所關聯。它們的控股股東分別隸屬於中國國務院國資委旗下的兩個不同的企業，國藥股份的控股股東是國藥控股，而中國醫藥的控股股東則是中國通用技術集團。因此，可以說它們之間存在間接的控制關系，但作為獨立的公司，它們在日常業務和決策上保持自主性。
國藥集團藥業股份有限公司（國藥股份）是由中國醫藥集團總公司發起成立，並在1999年經國家經貿委批準設立。其業務範圍廣泛，涵蓋了藥品生產、化學原料藥、西藥制劑、生化藥品、生物制品以及中成藥的銷售。此外，公司還涉足進出口業務、技術進出口、保健食品銷售以及相關咨詢服務。2016年，國藥股份因某些事項宣布停牌，並在隨後的公告中提及實際控制人承諾的延期，原定於2016年3月11日完成的承諾被延期至2017年3月11日。
總結來說，國藥股份和中國醫藥雖然不是直接的關聯企業，但它們在產權上受同壹上級集團的影響，各自獨立運營，遵循各自的業務策略和規劃。