梔子黃色素可抑制80%的亞麻油酸氧化，因此可作為抗氧化劑用於食品加工。其耐熱性好，80℃120分鐘色素殘留率在85%以上。在可見光範圍內(40lun -700nln)，光的照射是穩定的，但波長為250nm-390nm的光的照射是不穩定的。因此，梔子黃色素可作為抗氧化劑和著色劑應用於食品工業。
梔子黃色素對蛋白質和澱粉具有優異的染色能力，可廣泛應用於蛋糕、糖果、面粉、飲料、果凍、餅幹、冰淇淋等食品中。梔子黃色素不僅含有可著色的色素成分，還含有壹定的藥用價值高、價格昂貴的西紅花酸，如活血、活血、抗疲勞、止痛、降血壓等，可應用於醫藥工業。
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