1、系統適應性：藥品經營企業計算機系統應與企業的經營範圍和經營規模相適應，能夠實時控制並記錄藥品經營各環節和質量管理全過程。
2、數據管理：藥品經營企業計算機系統應能夠記錄和備份藥品的采購、銷售、庫存等信息，並保證數據的準確性和完整性。數據的更改應當經過適當的審核和監督。