自然界的水都含有各種不同的化學物質，這些物質都會影響存養生物的存活率，在城市中自來水近乎中性，但含有氯，在用於海鮮存養時壹定要除氯後方可使用。消除氯的方法，最簡單的是晾曬法，把水預先擱置3天後再用；在缺乏光照的地方，要存放壹星期才可使用。另外可采用化學法去氯，常用的去氯藥品有硫代硫酸鈉（俗稱海波）其反應方程式為：
Na2S2O3+4CL2+5H2O====2NaHSO4+8HCL
在壹般條件下，這個反應速度非常快。硫代硫酸鈉在水中溶解之後，稍加攪拌，反應即可完成。硫代硫酸鈉的用量要根據水中遊離氯的含量而定，壹般用量為10kg自來水加入1g硫代硫酸鈉。