水黴病最初寄生在魚身上，壹般看不出病魚有什麽異常癥狀，見到病癥時，菌絲已侵入魚體傷口，向外生長。
有時由於寄生蟲、細菌等病原體感染引起原發病竈潰爛，黴菌的動孢子會從魚體潰爛處侵入，吸食皮膚中的營養物質，在受傷病竈迅速繁殖、蔓延、擴大，逐漸長出棉絮狀的菌絲。
菌絲與傷口細胞組織糾纏粘連，使皮膚潰爛，組織壞死，同時，隨著病變面積的擴大，魚體負擔過重，遊動失調，食欲不振，魚體消瘦，最終病魚因體力不支而死亡。
這種病壹般發生在20℃以下的低水溫環境中，早春和冬末最易流行。
水黴菌對宿主沒有嚴格的選擇性，從魚卵到成魚的各種養殖魚類都容易感染。
密集放養越冬池中的魚、春季瘦水中的魚或處於饑餓狀態的魚最容易感染水黴病。
春季放養如果操作不當，也會導致水黴病爆發。