惡性綜合征（NMS） ：惡性綜合征（NMS）的臨床癥狀為：高熱、肌肉僵硬、精神狀態改變和植物神經系統功能紊亂（如脈搏和血壓不規則、心動過速、出汗和心律失常）；其他體征包括：
肌酸磷酸酶升高：肌酐磷酸酶升高、蛋白尿和急性腎衰竭。齊拉西酮也與 NMS 有關，其處理方法包括：壹旦出現 NMS，立即停用抗精神病藥物和其他非必要藥物；對癥支持性護理和密切監測；如果同時出現其他嚴重軀體疾病，則積極治療這些疾病。目前還沒有公認的治療 NMS 的有效方法。如果患者在康復後需要再次使用抗精神病藥物，應慎重考慮選擇合適的抗精神病藥物治療。由於有NMS復發的報道，因此必須密切監測患者的病情。
遲發性運動障礙（TD）：齊拉西酮的用藥方式應盡量減少TD的發生。如果接受齊拉西酮治療的患者出現遲發性運動障礙的體征或癥狀，應考慮停用齊拉西酮；然而，有些患者即使出現癥狀，也需要繼續接受齊拉西酮治療。
高血糖和II型糖尿病：據報道，服用非典型抗精神病藥物的患者會出現高血糖，而服用齊拉西酮的患者尚未出現高血糖和糖尿病。然而，尚不清楚齊拉西酮未見不良反應報道是否僅僅與臨床上少用該藥有關。
皮疹：在齊拉西酮上市前的試驗中，約有5%的患者出現皮疹/蕁麻疹，導致約1/6的患者停藥。
皮疹的發生率與齊拉西酮的劑量有關，但也可能與患者長期服用大劑量藥物有關。壹些皮疹患者出現了相關的全身癥狀和體征，如白細胞計數升高。絕大多數患者在使用抗組胺藥、類固醇或停藥等輔助措施後癥狀迅速改善。如果出現病因不明的皮疹，應停用齊拉西酮。
體位性低血壓：齊拉西酮可能會導致某些患者出現體位性低血壓，並伴有頭暈、心動過速和暈厥，尤其是在用藥初期和劑量調整期間。這可能與齊拉西酮的α1-腎上腺素能拮抗劑特性有關。齊拉西酮誘發暈厥的發生率為 0.6%。有心血管疾病史（心肌梗塞、缺血性心臟病、心力衰竭或傳導異常）、腦血管疾病或有易導致低血壓的軀體疾病史（脫水、血容量不足和服用降壓藥）的患者應慎用齊拉西酮。
癲癇發作 ：在臨床試驗期間，齊拉西酮誘發癲癇發作的發生率為0.4%。癲癇的病因復雜，與其他抗精神病藥物壹樣，有癲癇病史或癲癇發作閾值降低（如阿爾茨海默病，即早發性癡呆）的患者應慎用齊拉西酮。癲癇發作閾值降低的疾病在65歲以上的人群中更為常見。
吞咽困難：食道運動異常和誤吸都可能與服用抗精神病藥物有關。有吸入性肺炎風險的患者應慎用齊拉西酮和其他抗精神病藥物。
高泌乳素血癥 ：與其他多巴胺D2受體拮抗劑壹樣，齊拉西酮也會增加體內的催乳素水平。約1/3的乳腺癌患者可能是催乳素依賴型患者，因此確診為乳腺癌的患者應慎重考慮是否服用齊拉西酮。迄今為止的臨床和流行病學研究表明，長期服用齊拉西酮與精神病患者的腫瘤發生無關。目前可用的信息太少，無法做出最終結論。
認知和運動功能的潛在損害：齊拉西酮最常見的不良反應是嗜睡。在為期4至6周的安慰劑對照試驗中，齊拉西酮組和安慰劑組的嗜睡發生率分別為14%和7%。在短期臨床試驗中，因嗜睡而脫離藥物的患者比例為 0.3%。服藥期間，在合理確定齊拉西酮治療不會對這些活動產生不利影響之前，患者應謹慎從事需要精神支配的活動，如駕駛機動車輛或操作危險性機械。
陰莖異常勃起：在上市前的數據中，只有壹名患者出現陰莖異常勃起。陰莖異常勃起與齊拉西酮之間的關系尚未確定。具有α-腎上腺素能受體阻斷作用的藥物可誘發陰莖異常勃起，本品可能具有誘發陰莖異常勃起的作用。
體溫調節：盡管上市前沒有關於齊拉西酮影響體溫調節功能的報告，但由於抗精神病藥物能夠幹擾體溫調節中樞，如果患者患有導致體溫升高的疾病，如過度運動、暴露於酷熱環境、服用抗膽堿能藥物或處於脫水狀態，建議慎用齊拉西酮。
自殺：精神障礙患者都有自殺的可能，在藥物治療期間應密切監測高危患者。所開的齊拉西酮劑量應為有效控制癥狀的最小劑量，以盡量減少用藥過量的風險。
合並癥患者的用藥：齊拉西酮治療患有某些其他系統疾病的患者的臨床經驗有限，而且尚未系統評估齊拉西酮對近期患有心肌梗死或不穩定型心臟病的患者的療效。心臟病患者應慎用齊拉西酮。
2014年12月11日，美國食品和藥物管理局（FDA）發布信息警告稱，抗精神病藥物齊拉西酮（商品名為Geodon及其仿制藥）與壹種罕見但嚴重的皮膚反應 "嗜酸性粒細胞增多和全身癥狀相關的藥物反應"（DRESS）有關，這種皮膚反應可發展到身體的其他部位。根據這壹信息，FDA 建議患者如果出現發熱、皮疹和/或淋巴結腫大，應立即就醫，如果懷疑存在 DRESS，應立即停用齊拉西酮。