本專業培養具備制藥工程方面的知識，能在醫藥、農藥、精細化工和生物化工等部門從事醫藥產品合成與工藝研究、醫藥產品開發、應用研究和管理的高素質研究與應用型專門人才。
制藥工程是壹個化學、藥學（中藥學）和工學交叉的工科專業，以培養從事藥品制造新工藝、新設備、新品種的開發、放大和設計人才為目標。1998 年，這壹名稱正式出現在教育部本科專業目錄中。制藥工程專業名稱雖新，但從學科演變來看，其產生並非全新，是同類專業的延續，也是我國科技發展到壹定時期的產物。
制藥工程專業就業方向及就業前景分析：制藥工程專業培養以化學、藥學、制藥工程為基礎，輔以適當的生物學和醫學基礎知識，掌握化學藥物、天然藥物、生物藥物的研究、制備和生產的基本理論、基本知識、操作技能，能在制藥、農藥、食品、精細化工和生物化工等領域從事藥品生產、科技開發、藥品生產和開發、食品、精細化工和生物化工等方面工作的高級專門人才。藥品生產、科技開發、應用研究和管理的高級醫藥工程技術人員。
制藥工程就業方向：制藥工程專業畢業後可從事壹切與藥品相關的工作。研發人員：在制藥企業、高校、科研院所的科研部門，從事藥品研發工作；生產、技術人員：在制藥企業，從事藥品生產、技術工作；質量檢驗檢測人員：在制藥企業、食品廠、藥品檢驗所，從事食品藥品質量檢驗檢測工作；管理人員：在制藥企業，從事藥品生產和技術管理工作； 營銷人員：在制藥企業、藥品營銷公司，從事藥品營銷、內勤等工作； 制藥企業、藥品營銷公司，從事藥品營銷、營銷、內勤等工作； 制藥企業、藥品營銷公司，從事藥品營銷、營銷、內勤等工作。營銷、內勤等工作；藥師：在醫院藥房，從事制劑、質量控制、臨床藥學等工作；在藥廠、醫藥營銷公司，從事用藥指導和咨詢等工作；藥品檢驗員：在藥品檢驗所從事藥品質量鑒定和制定相應質量標準的工作；公司職員：在醫藥貿易公司或醫藥企業從事藥品流通和國內外貿易工作；藥品監管人員：公務員，在國家、省、市、縣藥監局，從事食品藥品質量監管等工作；研究生：報考生命科學、生物技術、藥學及相關專業研究生。
制藥工程就業前景：該專業學風好，教學師資水平高，但工作是自己找，行業就業率與學校無關。近幾年化工行業特別缺人，這個行業就業應該不難。但制藥企業不缺車間操作工、實驗研究員和分析員。就業學生中，85%在制藥企業，10%在化工行業，5%在其他行業，與本專業無關。25% 的藥學專業學生在車間工作，30% 的學生擔任研究分析員（主要是分析師），45% 的學生從事藥品銷售工作。現在學生因為地區不同，工資也不壹樣，東北是 1000 左右，河北山東 1200，大連上海，浙江江蘇能到 2000，深圳廣州 2500。單位的體制不同，福利也不壹樣，但至少有三險壹金，有的單位負責吃住。有的是發津貼，福利好的是國企和外企，但能學到私企的東西就不錯了。