另外，就算大蒜進入體內有殺菌作用，又怎麽區分好菌和壞菌呢？如果不能區分，就會壹起被殺死，導致腸道菌群紊亂。因此，沒有證據表明大蒜進入體內是為了殺菌，但提取的大蒜素對口腔有殺菌作用，但會對口腔黏膜造成強烈刺激。
研究人員證明，大蒜中含有的大蒜素及其含硫化合物是大蒜殺菌的主力軍，這使得大蒜被譽為“天然廣譜抗生素”。大蒜中含有能殺滅多種病原微生物如流行性腦脊髓膜炎病毒、流感病毒、傷寒、肝炎病毒、新型隱球菌、結核分枝桿菌、肺炎球菌、腦膜炎分枝桿菌、乙型腦炎病毒、副傷寒桿菌、阿米巴原蟲、陰道毛滴蟲、霍亂弧菌、葡萄球菌、痢疾誌賀氏菌、立克次體等的成分。此外，大蒜還能減慢心率，增加心肌收縮力，擴張外周血管，利尿，減輕實驗性動脈粥樣硬化，降低血脂，延緩動脈粥樣硬化的發展。所以，大蒜有殺菌作用是毋庸置疑的，但吃大蒜不宜過量，會刺激腸胃，對健康有害。
大蒜雖然好，但是壹天也就兩三片。腸胃不好、有眼疾、肝病、腹瀉等嚴重疾病的人不能吃。
大蒜在體外有抗菌作用，提取的大蒜素如果用於口腔可以殺死口腔細菌，但攝入體內就不會起到殺菌作用。大蒜提取物可能對大腸癌有效，證據不足。所以普通人把大蒜當蔬菜吃是可以的，但是花大價錢買大蒜提取物保健品就不劃算了。