2、拿到新的營業執照後再辦理新的稅務登記證、組織機構代碼證。
這是在原來的基礎上更換法人和名稱的做法，如果妳要把這個店註冊成公司的話，需要註冊資本，然後可以個人獨資，也可辦成合夥企業，個人獨資最低註冊10萬元，合夥最低註冊3萬元（股東最少2人）， 還需要辦理藥品經營許可證（到藥監局辦），辦藥品許可證比較復雜，需要有職業資格的專業醫務技術人員和庫房，註冊地、辦公地、經營地、庫房，都需要有房產證明和租賃協議，而且庫房有溫度、濕度、通風、滅火等考核規範，藥品的品種、生產廠家的資質證明和生產許可批文以及給妳們的經銷授權必須有還要到藥監局備案，很復雜，妳要有準備。
我個人建議：先按現有的經營模式來，把法人換成實際經營者，先完善壹下內部的管理，從醫務人員、進貨渠道、庫房、定價等各個方面規範起來，然後再把個體戶升級到公司（公司就是法人企業)，這麽做的話妳有壹個緩沖的過程。
從我的經驗來看，做個體比較靈活，成本比做公司的話低，包括稅費、銀行方面的支出、人員的聘用、工商管理、財務支出等。如果妳要做公司，首先財務核算要健全，需要有會計、出納做正規的賬目，需要到銀行開戶，而且聘用員工需要簽勞動合同，上社會保險，財務每月要報稅，收入支出稅務要查賬，證書要年檢（營業執照、銀行、稅務、藥品許可證）、、、
妳如果就是掙點錢，就開個體可以滿足妳的經營需求了，如果妳要做大，而且有信心和實力，必須做公司運作，正規化操作。有些藥品的經銷可以刷醫保卡或和社保聯合做的話必須搞大壹點，有點魄力。這個看妳覺得，首先妳要心中有數。
說了這麽多，妳先理理頭緒，有問題我們可以交流溝通。