1. 安眠藥
安眠藥是壹種作用於人體的鎮靜催眠藥，常見的安眠藥如舒樂安定、佐匹克隆，地西泮等等，但是咖啡因卻有著興奮中樞神經的作用，因為兩者的作用是完全的相反的，所以在服用鎮靜催眠類藥物時就不要喝咖啡啦。
2. 治療骨質疏松的藥物
總所周知咖啡會引起鈣質的流失減少人體對鈣的吸收，特別是黑咖啡，所以在服用鈣爾奇D，羅蓋全等，特別是咖啡因會讓阿侖膦酸鈉（福善美）的吸收率下降60%，從而促進鈣的進壹步流失。
3. 解熱鎮痛藥
常用的解熱鎮痛藥泰諾林，散利痛等中都含有會抑制某些物質合成的成分在裏面，從而使失去胃粘膜保護的胃更容易受到胃酸的侵蝕，而咖啡因則會刺激胃酸的分泌，加重這些藥物對胃粘膜的刺激。
4. 甲狀腺素類藥物
2008年有壹項研究發現如病人在服用甲狀腺素前或後不久喝了咖啡，藥物吸收效果會降低55%。所以在服用優甲樂，甲狀腺素鈉這壹類藥物的時候不要飲用咖啡。
5. 利尿降壓藥
咖啡因能夠促進腎臟的機能，有利尿的作用，並且可以加速多余鈉離子的排出，所以同時服用降壓藥會出現效果疊加的現象，特別是呋塞米這壹類排鉀利尿的藥物，而且咖啡本身就具有升高血壓的作用，所以在服用氫氯噻嗪，呋塞米，螺內酯等藥物時不要飲用咖啡。